香港特別行政區政府對從不同口岸入境人士的檢測安排有所不同，容易使旅客混淆及入境時帶來不便。3月31日港府宣布，4月1日起將統一從中國各地區（包括內地、澳門及臺灣）抵港人士接受新冠病毒核酸檢測的安排。

據港媒綜合報道，新安排實施前，來自內地、澳門和臺灣的人在不同口岸抵港時有不同的檢測安排。比如從香港國際機場入境者，必須在抵達后接受“檢測待行”安排；而從內地抵港的人則會獲得檢測樣本收集瓶，收集其抵港第12天的深喉唾液樣本再作檢測。新規實施之后，所有來自中國各地區的人員均需要在抵港時或抵港第2天以及第12天接受病毒檢測。

2020年11月23日起，特區政府實行“回港易”計劃，即香港居民如果回港前14天不曾到過香港、廣東省和澳門以外的地方，可免去返港14天強制隔離的安排。不少人質疑內地居民入境仍要強制隔離，認為現在內地絕大部分省份早就清零，入港者基本上無傳播風險。香港《星島日報》評論稱，近期要求港府在這方面撤限的聲音越來越大，有商界人士建議豁免政策擴大到其他省份的內地以及港澳居民。